83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1152    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  96.72 
 
 		 580 aa  1086    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  50 
 
 		 580 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  49.91 
 
 		 563 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  47.39 
 
 		 576 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  47.9 
 
 		 563 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  42.32 
 
 		 652 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  43.9 
 
 		 418 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  41.45 
 
 		 419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  42.37 
 
 		 415 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  41.03 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  40.79 
 
 		 415 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  40.79 
 
 		 415 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  40.29 
 
 		 415 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  40.29 
 
 		 415 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  40.29 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  40.39 
 
 		 415 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  35.75 
 
 		 393 aa  220  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  34.77 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  34.77 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  34.49 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  32.94 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  29.92 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  34.71 
 
 		 386 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  34.39 
 
 		 392 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  32.52 
 
 		 395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  30.98 
 
 		 387 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  32.36 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  30.43 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  31.38 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  32.78 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  29.85 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  31.64 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  32.75 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  31.48 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  30.98 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  25.74 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  27.48 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  27.43 
 
 		 384 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  31.75 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  27.64 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  24.04 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  52.38 
 
 		 155 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  40.87 
 
 		 149 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  42.98 
 
 		 152 aa  87  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  40.87 
 
 		 154 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  46.94 
 
 		 131 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  40.87 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  40.87 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  45.74 
 
 		 132 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  43.01 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  42.27 
 
 		 146 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  42.16 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  46.39 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  26.77 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  25.82 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  36.09 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  26.82 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  41.3 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  39.8 
 
 		 138 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  25.19 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  40.62 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  41.11 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  25.36 
 
 		 128 aa  54.7  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  32.93 
 
 		 644 aa  51.2  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  32.93 
 
 		 642 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  32.93 
 
 		 642 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  32 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  30.61 
 
 		 131 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  30.68 
 
 		 126 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  29.79 
 
 		 130 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  29.79 
 
 		 130 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  29.79 
 
 		 130 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  24.46 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>