53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46310 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  92.48 
 
 		 135 aa  253  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  65.85 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  61.72 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  59.38 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  57.81 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  56.72 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  58.59 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  54.69 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  59.38 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  55.81 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  54.26 
 
 		 138 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  54.4 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  54.26 
 
 		 138 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  55.46 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  53.23 
 
 		 286 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  53.23 
 
 		 286 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  52.42 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  44.63 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.36 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  35.8 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.47 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30.85 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  27.34 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  30.68 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  23.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  23.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.95 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  31.18 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  34.57 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  24.58 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  33.78 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  31.82 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  33.78 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  33.78 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  26.72 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  40  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>