More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  72.52 
 
 
496 aa  689  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  77.69 
 
 
484 aa  766  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  74.38 
 
 
484 aa  750  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  979  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  75.21 
 
 
484 aa  747  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  75.21 
 
 
484 aa  759  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  75 
 
 
484 aa  757  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  75 
 
 
484 aa  759  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  74.38 
 
 
484 aa  746  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  96.07 
 
 
484 aa  895  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  78.26 
 
 
479 aa  777  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  62.53 
 
 
476 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  51.02 
 
 
494 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  50.31 
 
 
543 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  51.04 
 
 
512 aa  438  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.42 
 
 
497 aa  440  1e-122  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.14 
 
 
493 aa  440  1e-122  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  50.31 
 
 
515 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  49.05 
 
 
487 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  48.96 
 
 
500 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.61 
 
 
480 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  48.53 
 
 
498 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  47.26 
 
 
493 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  45.36 
 
 
480 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.39 
 
 
504 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  47.16 
 
 
490 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.88 
 
 
492 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.91 
 
 
504 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  48.41 
 
 
527 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  44.61 
 
 
496 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  48.24 
 
 
528 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.02 
 
 
526 aa  406  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  48.24 
 
 
528 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.48 
 
 
481 aa  406  1e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.89 
 
 
516 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.77 
 
 
504 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  45.67 
 
 
492 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.9 
 
 
523 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.43 
 
 
505 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.38 
 
 
488 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.51 
 
 
520 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.38 
 
 
488 aa  400  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  48.16 
 
 
485 aa  399  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  48.33 
 
 
516 aa  402  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  47.17 
 
 
496 aa  400  1e-110  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.45 
 
 
492 aa  400  1e-110  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.87 
 
 
485 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.9 
 
 
507 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  47.14 
 
 
485 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  45.64 
 
 
507 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.87 
 
 
542 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  46.98 
 
 
515 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.83 
 
 
537 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.12 
 
 
530 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.23 
 
 
518 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.95 
 
 
506 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.55 
 
 
467 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  47.07 
 
 
501 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  43.27 
 
 
499 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  44.35 
 
 
483 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  46.53 
 
 
512 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  46.85 
 
 
505 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  46.65 
 
 
505 aa  362  7e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  46.85 
 
 
505 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.65 
 
 
505 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.01 
 
 
486 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.65 
 
 
505 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.46 
 
 
505 aa  358  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.46 
 
 
505 aa  358  1e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.2 
 
 
507 aa  357  2e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.19 
 
 
507 aa  357  2e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  44.6 
 
 
507 aa  357  3e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  46.94 
 
 
592 aa  352  9e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  48.09 
 
 
484 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.9 
 
 
552 aa  345  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.6 
 
 
571 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.37 
 
 
467 aa  339  6e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  43.87 
 
 
467 aa  339  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.74 
 
 
461 aa  313  3e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.19 
 
 
468 aa  304  2e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.44 
 
 
514 aa  282  8e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.74 
 
 
490 aa  273  4e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  33.4 
 
 
1363 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.39 
 
 
470 aa  253  4e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  31.83 
 
 
1387 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.96 
 
 
450 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.6 
 
 
164 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.26 
 
 
305 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  41.32 
 
 
156 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  44.1 
 
 
164 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.91 
 
 
165 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.91 
 
 
165 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  42.24 
 
 
160 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.99 
 
 
164 aa  123  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5132  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.45 
 
 
183 aa  122  1e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1223  putative oxidoreductase  43.06 
 
 
183 aa  121  2e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.54 
 
 
157 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4209  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.06 
 
 
182 aa  120  5e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  43.24 
 
 
233 aa  120  5e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.77 
 
 
158 aa  120  5e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.54076e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>