More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  100 
 
 
349 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  63.69 
 
 
351 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  65.99 
 
 
354 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  62.97 
 
 
349 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  42.73 
 
 
346 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  40.23 
 
 
346 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  36.57 
 
 
349 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  36.73 
 
 
345 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  36.95 
 
 
349 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  39.36 
 
 
355 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  39.07 
 
 
355 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  38.78 
 
 
356 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  35.38 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  35.38 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  35.38 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  35.38 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  35.38 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.91 
 
 
362 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.72 
 
 
355 aa  209  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.61 
 
 
392 aa  208  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.44 
 
 
354 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.52 
 
 
356 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.33 
 
 
368 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.2 
 
 
357 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.62 
 
 
362 aa  203  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.98 
 
 
360 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  33.99 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  35.45 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.29 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.51 
 
 
360 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.09 
 
 
381 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1391  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.4 
 
 
360 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.88 
 
 
350 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  33.33 
 
 
360 aa  192  9e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  34.1 
 
 
356 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  34.1 
 
 
356 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  34.1 
 
 
356 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  34.1 
 
 
356 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3484  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.8 
 
 
376 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  33.53 
 
 
352 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.56 
 
 
358 aa  189  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0092  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
376 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  33.82 
 
 
356 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.36 
 
 
360 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  32.56 
 
 
369 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.45 
 
 
384 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.33 
 
 
363 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  34.48 
 
 
352 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.78 
 
 
363 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  34.65 
 
 
352 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  32.11 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  33.8 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.86 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  33.8 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  33.8 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.89 
 
 
381 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.85 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.49 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.66 
 
 
350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.9 
 
 
353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.41 
 
 
383 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  34.41 
 
 
359 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.81 
 
 
357 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.95 
 
 
383 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2334  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
386 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.46 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.29 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  34.37 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.14 
 
 
353 aa  180  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0086  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.96 
 
 
376 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0839  surface presentation of antigens protein SpaS  36.1 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.43 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  32 
 
 
374 aa  179  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.57 
 
 
390 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2164  surface presentation of antigens protein SpaS  36.21 
 
 
406 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.38 
 
 
357 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1533  surface presentation of antigens protein SpaS  35.9 
 
 
411 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.28 
 
 
376 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0573  surface presentation of antigens protein SpaS  36.21 
 
 
411 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2071  surface presentation of antigens protein SpaS  35.9 
 
 
411 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.086614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2076  surface presentation of antigens protein SpaS  36.21 
 
 
411 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0751  surface presentation of antigens protein SpaS  35.9 
 
 
411 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1749  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.92 
 
 
359 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.1 
 
 
359 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.95 
 
 
378 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.94 
 
 
373 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.55 
 
 
360 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.61 
 
 
376 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.56 
 
 
358 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.02 
 
 
376 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.3 
 
 
366 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.99 
 
 
377 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3987  flagellar biosynthetic protein FlhB  33.43 
 
 
376 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.13 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.9 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.71 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.84 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  32.25 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0864  type III secretion system protein HrcU  36.34 
 
 
357 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.46 
 
 
376 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>