66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  98.94 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  78.49 
 
 
93 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  78.79 
 
 
115 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  78.49 
 
 
93 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  76.53 
 
 
143 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  78.49 
 
 
93 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  81.11 
 
 
90 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  75.27 
 
 
117 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  78.49 
 
 
94 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  74.19 
 
 
95 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.96 
 
 
93 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  38.27 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  38.27 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  38.64 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  38.55 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  37.97 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  40.23 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  37.97 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  37.04 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  37.04 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  37.04 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  37.04 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  37.21 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  36.71 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  38.46 
 
 
88 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  37.18 
 
 
108 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  44.19 
 
 
92 aa  60.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  30.34 
 
 
109 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  34.57 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  34.57 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  41.56 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  32.91 
 
 
92 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  35.38 
 
 
93 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  32.5 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  34.62 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  36.23 
 
 
114 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  35.29 
 
 
82 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  31.65 
 
 
81 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  31.65 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  32.99 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  26.83 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  30.49 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  39.71 
 
 
96 aa  47.8  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  33.73 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  34.29 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  29.03 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  29.17 
 
 
377 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  32.5 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  26.67 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  35.06 
 
 
95 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  35.37 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  36 
 
 
96 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
113 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  32.86 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  32.31 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  32.05 
 
 
90 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  24.39 
 
 
93 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  33.78 
 
 
113 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>