143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  98.42 
 
 
253 aa  505  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  75.81 
 
 
253 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  75.4 
 
 
253 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  73.79 
 
 
252 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  75.9 
 
 
252 aa  357  1e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  74.59 
 
 
257 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  70.33 
 
 
254 aa  342  3e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  72.54 
 
 
266 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  72.54 
 
 
257 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  72.95 
 
 
257 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  33.05 
 
 
246 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  36.79 
 
 
241 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  41.56 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  41.03 
 
 
270 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
270 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
270 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
270 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  40.26 
 
 
270 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  41.72 
 
 
270 aa  112  7e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  39.87 
 
 
270 aa  112  8e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.16138e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  41.72 
 
 
270 aa  112  8e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  31 
 
 
259 aa  110  2e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  40.26 
 
 
289 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
271 aa  109  4e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  34.21 
 
 
245 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 
287 aa  108  8e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
260 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
262 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
262 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  37.36 
 
 
257 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  28.34 
 
 
240 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
273 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  35.91 
 
 
233 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  32.37 
 
 
238 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  30.42 
 
 
278 aa  99  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  32.05 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  27.9 
 
 
294 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  31.38 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  33.89 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  30.5 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
251 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  27.59 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  31.6 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
239 aa  84  2e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  29.95 
 
 
243 aa  83.2  4e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  29.95 
 
 
243 aa  82.8  5e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
245 aa  81.3  1e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  28.79 
 
 
273 aa  81.3  1e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
245 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.75678e-08  decreased coverage  3.00845e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
245 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
245 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  9.22882e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  29.67 
 
 
245 aa  79  6e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.18598e-07  decreased coverage  9.00538e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  29.3 
 
 
297 aa  77.8  1e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  30.13 
 
 
248 aa  78.6  1e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.32095e-05  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  30.59 
 
 
240 aa  77.8  1e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  30.14 
 
 
240 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  28.43 
 
 
248 aa  76.3  5e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  27.8 
 
 
244 aa  75.9  6e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  30.14 
 
 
240 aa  75.9  6e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  30.14 
 
 
240 aa  75.9  6e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  28.43 
 
 
251 aa  75.5  8e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  29.68 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
244 aa  74.7  1e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.64941e-09  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.04202e-06  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
244 aa  74.7  1e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.32187e-06  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  29.68 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.68 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  29.68 
 
 
240 aa  74.7  1e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  28.09 
 
 
247 aa  74.3  2e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  29.21 
 
 
245 aa  72.8  5e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  26.13 
 
 
261 aa  71.2  2e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
235 aa  68.6  9e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  30.13 
 
 
239 aa  67  3e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
246 aa  67  3e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.4143e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
238 aa  66.6  3e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  30.46 
 
 
244 aa  66.6  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.51541e-06  hitchhiker  1.67474e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  33.12 
 
 
240 aa  66.6  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
244 aa  65.9  6e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.0952e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  23.35 
 
 
281 aa  65.5  8e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  28.31 
 
 
240 aa  65.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  31.61 
 
 
240 aa  65.1  9e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  28.31 
 
 
240 aa  65.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  28.31 
 
 
240 aa  65.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  28.31 
 
 
240 aa  65.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  27.85 
 
 
240 aa  64.3  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>