244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  69.98 
 
 
484 aa  684  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  71.43 
 
 
484 aa  669  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  69.77 
 
 
484 aa  678  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  70.19 
 
 
484 aa  683  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 
484 aa  676  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  70.19 
 
 
484 aa  686  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  75.62 
 
 
484 aa  702  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 
484 aa  673  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  70.81 
 
 
484 aa  666  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  70.39 
 
 
484 aa  688  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  69.36 
 
 
483 aa  646  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
484 aa  960  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  95.87 
 
 
484 aa  885  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  74.79 
 
 
484 aa  704  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  69.98 
 
 
483 aa  658  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  74.79 
 
 
484 aa  698  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  53.44 
 
 
481 aa  493  1e-138  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  54.7 
 
 
480 aa  494  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  52.4 
 
 
481 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  53.03 
 
 
480 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  53.03 
 
 
481 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.86 
 
 
480 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  54.64 
 
 
480 aa  469  1e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  54.43 
 
 
480 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  54.43 
 
 
480 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  54.43 
 
 
480 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  54.43 
 
 
480 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 
480 aa  469  1e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  52.4 
 
 
480 aa  466  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 
480 aa  465  1e-130  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  53.59 
 
 
480 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 
480 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  52.51 
 
 
480 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  53.16 
 
 
480 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  55.03 
 
 
493 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.79 
 
 
490 aa  418  1e-115  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.59 
 
 
472 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.42 
 
 
481 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  47.15 
 
 
481 aa  400  1e-110  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.18 
 
 
482 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  48.65 
 
 
498 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.46 
 
 
482 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  42.92 
 
 
485 aa  353  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  39.79 
 
 
482 aa  349  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.86 
 
 
466 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.16 
 
 
466 aa  344  3e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.96 
 
 
498 aa  343  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.54 
 
 
500 aa  338  1e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  40.6 
 
 
466 aa  322  1e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  40.49 
 
 
484 aa  315  2e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  38.25 
 
 
482 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  37.5 
 
 
482 aa  305  8e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.5 
 
 
482 aa  305  8e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  40.29 
 
 
510 aa  305  1e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.9 
 
 
488 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 
479 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.65 
 
 
488 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.76 
 
 
483 aa  286  6e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  39.55 
 
 
498 aa  285  2e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.56 
 
 
482 aa  283  6e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.86 
 
 
481 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.92 
 
 
483 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  38.38 
 
 
484 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  38.17 
 
 
484 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.43 
 
 
484 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.98 
 
 
483 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  34.86 
 
 
485 aa  275  2e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  34.71 
 
 
484 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.68 
 
 
494 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  38.27 
 
 
484 aa  270  3e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.88 
 
 
491 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  33.33 
 
 
478 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.94 
 
 
485 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.17 
 
 
481 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.7 
 
 
483 aa  267  3e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  37.91 
 
 
488 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.52 
 
 
485 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.21 
 
 
488 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.62 
 
 
466 aa  263  5e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  33.26 
 
 
486 aa  260  5e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  33.98 
 
 
487 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.49 
 
 
483 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.63 
 
 
485 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  39.2 
 
 
484 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  34.52 
 
 
483 aa  257  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.05 
 
 
483 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.63 
 
 
482 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  34.18 
 
 
486 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.92 
 
 
483 aa  255  1e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.02 
 
 
491 aa  255  1e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.83 
 
 
485 aa  254  2e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.86 
 
 
485 aa  254  2e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  34.5 
 
 
479 aa  254  2e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.57 
 
 
498 aa  253  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.36 
 
 
483 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  32.37 
 
 
485 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.16 
 
 
483 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  35.58 
 
 
485 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.59 
 
 
479 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  33.74 
 
 
483 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>