More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37915 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  100 
 
 		 471 aa  890    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  58.61 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  59.96 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  58.6 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 486 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  49.53 
 
 		 489 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  55.99 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1431  major facilitator superfamily MFS_1  54.75 
 
 		 733 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634406  normal  0.254269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.91 
 
 		 487 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 513 aa  297  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.34 
 
 		 498 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 		 487 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 		 527 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  41.12 
 
 		 492 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.84 
 
 		 763 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.58 
 
 		 490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  39.2 
 
 		 497 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.44 
 
 		 519 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.52 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  37.02 
 
 		 498 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.69 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.5 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 506 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 479 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.86 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.65 
 
 		 505 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.23 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.23 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.23 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 507 aa  216  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.26 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.73 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.9 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.9 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  42.58 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.58 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 788 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.09 
 
 		 480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 487 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  42.09 
 
 		 480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  42.09 
 
 		 480 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.34 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  39.24 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 553 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.11 
 
 		 548 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  36.92 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.29 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  39.75 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.89 
 
 		 534 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 503 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 487 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 1112 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  35.24 
 
 		 543 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.19 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.55 
 
 		 494 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.19 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.63 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.63 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.55 
 
 		 497 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.64 
 
 		 757 aa  199  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.39 
 
 		 487 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  37.65 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.18 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>