169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  93.9 
 
 
213 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  70.19 
 
 
219 aa  297  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  72.68 
 
 
209 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  70.73 
 
 
209 aa  291  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  67.79 
 
 
212 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  68.12 
 
 
212 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  69.76 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  68.78 
 
 
213 aa  284  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  67.8 
 
 
213 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  67.8 
 
 
213 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  67.32 
 
 
213 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  67.32 
 
 
213 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  67.32 
 
 
213 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  66.83 
 
 
213 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  66.67 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  66.67 
 
 
213 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  67.15 
 
 
242 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  65.69 
 
 
209 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  66.67 
 
 
213 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  66.67 
 
 
213 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  66.67 
 
 
213 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  66.67 
 
 
242 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  66.67 
 
 
242 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  58.54 
 
 
209 aa  251  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  58.17 
 
 
221 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  57 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  57.28 
 
 
223 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  55.71 
 
 
217 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  56.34 
 
 
216 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  52.17 
 
 
209 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  48.06 
 
 
209 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  43.27 
 
 
209 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  47.06 
 
 
201 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  42.31 
 
 
209 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  47.03 
 
 
213 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  42.45 
 
 
209 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  42.92 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  42.31 
 
 
209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  41.59 
 
 
209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  42.45 
 
 
209 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  41.98 
 
 
209 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  41.83 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  41.83 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  41.35 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  43.84 
 
 
200 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  38.79 
 
 
227 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  33.17 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  33.17 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  34.47 
 
 
213 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.84 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.58 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  33.5 
 
 
203 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.33 
 
 
210 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.06 
 
 
226 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  34.11 
 
 
237 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  30.1 
 
 
226 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.99 
 
 
209 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  33.33 
 
 
209 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.24 
 
 
209 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  27.67 
 
 
215 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.77 
 
 
213 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.77 
 
 
213 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  30.28 
 
 
215 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  32.66 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  30.1 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  33.13 
 
 
192 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.19 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  31.07 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  28.16 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.58 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.7 
 
 
205 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.64 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.78 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  27.59 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.8 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  32.2 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  26.11 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.12 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.87 
 
 
377 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  28.35 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  33.33 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.2 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.12 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.78 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.35 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.97 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.92 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.02 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  25.68 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.59 
 
 
280 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  27.42 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.07 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.94 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.94 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.41 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.05 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  25.36 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>