227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  97.31 
 
 		 409 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  100 
 
 		 409 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  55.48 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  55.48 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  55.26 
 
 		 416 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  57.35 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  54.52 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  53.27 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  53.46 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  53.37 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  51.26 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  50.25 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  49.5 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  50.5 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  49.64 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  48.68 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  50.89 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  48.44 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  49.88 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  48.44 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  48.43 
 
 		 421 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  50.13 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  47.49 
 
 		 415 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  50.73 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  50.73 
 
 		 416 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  45.07 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  49.76 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  46.25 
 
 		 433 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  47.97 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  43.95 
 
 		 433 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  43.9 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  43.95 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  45.59 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  45.07 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  45.1 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  45.22 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43.14 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  44.17 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  41.83 
 
 		 420 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.71 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  42.5 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  42.49 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  43.45 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  43.63 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  43.87 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.23 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.23 
 
 		 416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  43.73 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  43.54 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  44.84 
 
 		 416 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  44.63 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  41.51 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  42.2 
 
 		 460 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  43 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  42.27 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  44.78 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  43.41 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  44.76 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  43.37 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  43.37 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  42.68 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  43.24 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  43.39 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  42.05 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  42.65 
 
 		 419 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  43.7 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  42.68 
 
 		 422 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  41.2 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  42.53 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  40.95 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  42.68 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  43.15 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  42.39 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  41.53 
 
 		 440 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  42.64 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  41.85 
 
 		 412 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  41.89 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  41.63 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  41.06 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  42.32 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  41.36 
 
 		 412 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  41.79 
 
 		 415 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  41.61 
 
 		 412 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  42.68 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  39.86 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  41.39 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  42.79 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.83 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  42.44 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.58 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40.81 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  43.1 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  40.05 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  40.45 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  41.57 
 
 		 416 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  40.14 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  38.5 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  42.89 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  40.94 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  38.2 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>