298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  46.27 
 
 		 875 aa  770    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.85 
 
 		 883 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.08 
 
 		 864 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  46.43 
 
 		 854 aa  728    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  69.37 
 
 		 868 aa  1121    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.49 
 
 		 929 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.36 
 
 		 887 aa  752    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  100 
 
 		 872 aa  1746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.08 
 
 		 863 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  46.62 
 
 		 883 aa  785    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  46.43 
 
 		 854 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.03 
 
 		 850 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  42.74 
 
 		 853 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  42.62 
 
 		 853 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  42.51 
 
 		 853 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  42.81 
 
 		 853 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  42.51 
 
 		 853 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.46 
 
 		 866 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.36 
 
 		 861 aa  545  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.82 
 
 		 901 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  38.58 
 
 		 901 aa  538  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.34 
 
 		 1040 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.49 
 
 		 880 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.63 
 
 		 870 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  37.63 
 
 		 870 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.74 
 
 		 852 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.14 
 
 		 872 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.74 
 
 		 850 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.46 
 
 		 867 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.06 
 
 		 963 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.25 
 
 		 851 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.42 
 
 		 866 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.12 
 
 		 930 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  36.99 
 
 		 914 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  36.88 
 
 		 914 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.79 
 
 		 856 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  36.88 
 
 		 913 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  37.72 
 
 		 844 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.91 
 
 		 886 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  39.27 
 
 		 842 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  35.91 
 
 		 939 aa  482  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.86 
 
 		 852 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.1 
 
 		 884 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.37 
 
 		 880 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  33.02 
 
 		 870 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  33.14 
 
 		 870 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  33.02 
 
 		 870 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.07 
 
 		 871 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  33.02 
 
 		 870 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  33.14 
 
 		 870 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.93 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.8 
 
 		 866 aa  419  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.44 
 
 		 851 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  32.69 
 
 		 866 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  32.69 
 
 		 866 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.69 
 
 		 866 aa  415  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.13 
 
 		 877 aa  416  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.69 
 
 		 866 aa  412  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.07 
 
 		 819 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  31.83 
 
 		 871 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  32.46 
 
 		 866 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  32.57 
 
 		 866 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.96 
 
 		 876 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  31.93 
 
 		 878 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.93 
 
 		 878 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  32.05 
 
 		 863 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  31.93 
 
 		 878 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.81 
 
 		 837 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  32.13 
 
 		 878 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  34.18 
 
 		 839 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  33.68 
 
 		 851 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  31.72 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  31.72 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  32.05 
 
 		 856 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  31.72 
 
 		 809 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  31.6 
 
 		 809 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.46 
 
 		 828 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  31.48 
 
 		 809 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.38 
 
 		 833 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.75 
 
 		 840 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  32.55 
 
 		 866 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.55 
 
 		 865 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  33.56 
 
 		 866 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  32.55 
 
 		 861 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  32.48 
 
 		 866 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.93 
 
 		 890 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  30.93 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  31.46 
 
 		 865 aa  386  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  31.91 
 
 		 866 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  33.33 
 
 		 888 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.81 
 
 		 888 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  31.01 
 
 		 888 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  31.01 
 
 		 873 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  31.01 
 
 		 888 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  32.99 
 
 		 839 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  31.94 
 
 		 866 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  32.14 
 
 		 866 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 837 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2339  fimbrial usher protein  33.01 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.365526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.87 
 
 		 875 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>