More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  64.72 
 
 
585 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  97.41 
 
 
580 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  50.27 
 
 
583 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  50.09 
 
 
583 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  43.86 
 
 
565 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.39 
 
 
535 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  33.22 
 
 
541 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.39 
 
 
542 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.07 
 
 
569 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.81 
 
 
537 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.33 
 
 
574 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.07 
 
 
553 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.81 
 
 
589 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.08 
 
 
601 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
613 aa  216  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.44 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 
608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.96 
 
 
573 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.04 
 
 
545 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.93 
 
 
569 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  31.28 
 
 
560 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  31.02 
 
 
576 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.28 
 
 
542 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.97 
 
 
564 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.43 
 
 
556 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.97 
 
 
543 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.13 
 
 
560 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.93 
 
 
620 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.77 
 
 
569 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
538 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  29.71 
 
 
560 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.91 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.59 
 
 
564 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.82 
 
 
530 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.99 
 
 
583 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.99 
 
 
583 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 
558 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.57 
 
 
576 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  30.49 
 
 
574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 
603 aa  183  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.1 
 
 
560 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.62 
 
 
543 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.73 
 
 
565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.62 
 
 
555 aa  181  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
573 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
606 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.4 
 
 
565 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.95 
 
 
616 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.84 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.84 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.84 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.47 
 
 
564 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.53 
 
 
596 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.57 
 
 
557 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 
584 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.92 
 
 
544 aa  170  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.95 
 
 
583 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.74 
 
 
550 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  28.74 
 
 
575 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 
543 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.09 
 
 
550 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29.14 
 
 
553 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  29.3 
 
 
529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.68 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 
527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27.19 
 
 
544 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
550 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 
545 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
619 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.31 
 
 
540 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.51 
 
 
583 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 
553 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
548 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.77 
 
 
556 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  26.78 
 
 
563 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  27.42 
 
 
563 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.57 
 
 
541 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.39 
 
 
540 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 
547 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.35 
 
 
556 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.09 
 
 
552 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.78 
 
 
520 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.09 
 
 
580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.17 
 
 
544 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.89 
 
 
536 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.89 
 
 
536 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.89 
 
 
536 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  30.41 
 
 
536 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.67 
 
 
538 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.45 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.51 
 
 
547 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.63 
 
 
522 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  29.28 
 
 
568 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
568 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  30.5 
 
 
536 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.59 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.9 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>