More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  77.25 
 
 
465 aa  686  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  77.04 
 
 
465 aa  680  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  78.7 
 
 
471 aa  682  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  78.48 
 
 
471 aa  702  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32380  multidrug efflux outer membrane protein OprN precursor  100 
 
 
472 aa  921  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0450823  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2743  outer membrane protein OprN precursor  97.67 
 
 
472 aa  826  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  78.35 
 
 
462 aa  667  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  78.48 
 
 
471 aa  703  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  76.75 
 
 
473 aa  703  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  78.92 
 
 
471 aa  705  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.31 
 
 
482 aa  417  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.03 
 
 
473 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  43.28 
 
 
470 aa  320  2e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0890  outer membrane protein  40.51 
 
 
480 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.189882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4126  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.58 
 
 
460 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09500  outer membrane protein  39.91 
 
 
487 aa  282  8e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  41.67 
 
 
499 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  38.79 
 
 
503 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  36.44 
 
 
479 aa  273  4e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  35.02 
 
 
489 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  35.02 
 
 
479 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.63 
 
 
494 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  37.18 
 
 
479 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  37.03 
 
 
512 aa  267  3e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3623  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.41 
 
 
503 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  38.03 
 
 
479 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.41 
 
 
503 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.918566  hitchhiker  0.00837312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1006  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.7 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0211246  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5539  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.41 
 
 
503 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.541532  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.22 
 
 
497 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.03 
 
 
529 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.47 
 
 
493 aa  260  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  35.53 
 
 
496 aa  259  5e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.65 
 
 
495 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3932  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.43 
 
 
491 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 
495 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.02 
 
 
502 aa  254  2e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.8 
 
 
495 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0165  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.22 
 
 
477 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  35.4 
 
 
504 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  34.18 
 
 
520 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
486 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.51 
 
 
509 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.62 
 
 
496 aa  246  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.703187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.47 
 
 
489 aa  244  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5459  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.61 
 
 
493 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.0370061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3212  putative outer membrane protein  32.92 
 
 
494 aa  242  8e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.81 
 
 
495 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
495 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
495 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.73 
 
 
513 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.48 
 
 
501 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.53 
 
 
512 aa  239  6e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.12 
 
 
483 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.82 
 
 
500 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  33.91 
 
 
558 aa  236  5e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.42 
 
 
483 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.61 
 
 
483 aa  235  1e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0870  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.8 
 
 
493 aa  235  1e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.58 
 
 
494 aa  234  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  1.21747e-09 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  33.4 
 
 
569 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  36.51 
 
 
512 aa  233  4e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000656  putative outer membrane protein  32.92 
 
 
500 aa  233  7e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  34.38 
 
 
547 aa  233  7e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.28 
 
 
484 aa  233  8e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  37.77 
 
 
479 aa  233  8e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.34 
 
 
518 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1301  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.76 
 
 
514 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.84 
 
 
484 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  33.06 
 
 
477 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 
483 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.31 
 
 
517 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3597  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.97 
 
 
501 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6626  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.78 
 
 
508 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.45 
 
 
521 aa  228  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.51 
 
 
512 aa  226  5e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0034  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.69 
 
 
538 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.677331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.88 
 
 
495 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.54 
 
 
541 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18790  putative outer membrane efflux protein  35.41 
 
 
491 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0851472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.57 
 
 
515 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.04 
 
 
517 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1154  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.28 
 
 
473 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182996  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5590  NodT family outer membrane lipoprotein  38.28 
 
 
485 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 
485 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.96 
 
 
520 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.23 
 
 
546 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.5 
 
 
533 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.29 
 
 
457 aa  223  5e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.4 
 
 
525 aa  223  5e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.09 
 
 
470 aa  222  1e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2483  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.47 
 
 
486 aa  222  1e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1918  outer membrane efflux protein  32.48 
 
 
489 aa  222  1e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 
511 aa  221  2e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.13 
 
 
499 aa  221  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.4 
 
 
494 aa  221  2e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  33.69 
 
 
511 aa  221  2e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.27 
 
 
531 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00459  outer membrane protein OprN  36.53 
 
 
497 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4319  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.9 
 
 
483 aa  220  4e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.239033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>