More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  53.36 
 
 
610 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  52.55 
 
 
609 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  83.39 
 
 
607 aa  1050    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  53.19 
 
 
610 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  53.31 
 
 
626 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  83.72 
 
 
607 aa  1053    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  53.36 
 
 
610 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  52.71 
 
 
609 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  84.05 
 
 
607 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  52.96 
 
 
607 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  52.86 
 
 
617 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  53.37 
 
 
609 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  82.73 
 
 
607 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  53.2 
 
 
609 aa  673    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  52.05 
 
 
609 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  53.19 
 
 
610 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  84.05 
 
 
607 aa  1067    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  54.82 
 
 
613 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  53.52 
 
 
610 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  52.05 
 
 
609 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  56.46 
 
 
607 aa  691    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  83.62 
 
 
585 aa  1013    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  53.19 
 
 
610 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  52.06 
 
 
608 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  53.28 
 
 
609 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  53.36 
 
 
610 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  53.36 
 
 
610 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  52.54 
 
 
610 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  52.38 
 
 
610 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  56.86 
 
 
612 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  53.19 
 
 
610 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  51.64 
 
 
609 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  53.03 
 
 
610 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  58.71 
 
 
604 aa  724    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  53.36 
 
 
610 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  52.86 
 
 
610 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  84.7 
 
 
607 aa  1078    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  52.7 
 
 
617 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  53.52 
 
 
610 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  83.39 
 
 
607 aa  1050    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  53.36 
 
 
610 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  53.04 
 
 
609 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  53.04 
 
 
609 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  54.05 
 
 
611 aa  683    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  98.52 
 
 
608 aa  1227    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  53.8 
 
 
609 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
608 aa  1241    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  52.22 
 
 
609 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  52.87 
 
 
609 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  57.31 
 
 
607 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  53.03 
 
 
610 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  83.88 
 
 
607 aa  1058    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  52.54 
 
 
610 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  52.88 
 
 
606 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  54.32 
 
 
610 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  58.91 
 
 
619 aa  723    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  60.17 
 
 
609 aa  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  52.33 
 
 
609 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  53.98 
 
 
657 aa  634  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  50.08 
 
 
610 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  49.83 
 
 
599 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  53.14 
 
 
588 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  53.73 
 
 
588 aa  627  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  51.99 
 
 
609 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  53.22 
 
 
588 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 
610 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  51.72 
 
 
609 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  49.04 
 
 
639 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  50.98 
 
 
609 aa  613  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  49.09 
 
 
618 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  48.76 
 
 
618 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  49.75 
 
 
608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  50.41 
 
 
603 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  50.74 
 
 
621 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  50.83 
 
 
627 aa  599  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 
614 aa  601  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  48.76 
 
 
613 aa  598  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  52.18 
 
 
645 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  51.91 
 
 
614 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  49.01 
 
 
599 aa  594  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  51.85 
 
 
614 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  51.25 
 
 
598 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  50.5 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  50.5 
 
 
605 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  48.93 
 
 
608 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  49.09 
 
 
623 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  50.66 
 
 
606 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  47.96 
 
 
657 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  47.74 
 
 
657 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  47.85 
 
 
673 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  46.83 
 
 
654 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  47.85 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  46.6 
 
 
653 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  47.46 
 
 
649 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  46.91 
 
 
666 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  46.92 
 
 
663 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
674 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  46.21 
 
 
673 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  44.21 
 
 
677 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  44.67 
 
 
617 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>