More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30240 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  98.61 
 
 
72 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0744  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1688  translation initiation factor 1  87.5 
 
 
72 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000115833  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  88.89 
 
 
72 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2366  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.302955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2266  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2604  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.62411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2691  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000360853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1713  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.846652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1981  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  87.5 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  87.5 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1762  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  133  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2531  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1835  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000358057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2253  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000207147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1734  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
73 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1734  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
73 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2584  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000190707  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2464  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2625  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1880  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000177082  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1649  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121348  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1724  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000101127  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1754  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000140297  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2226  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000048053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1567  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216088  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
72 aa  130  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0322  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0381418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
83 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
83 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
77 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
77 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
75 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
75 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  72.22 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  75 
 
 
73 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1932  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 
74 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000750543  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
73 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 
72 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
74 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0788  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>