More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  62.41 
 
 		 688 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  57.4 
 
 		 716 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  67.04 
 
 		 714 aa  934    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.86 
 
 		 714 aa  935    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.76 
 
 		 714 aa  930    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.18 
 
 		 714 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  62.41 
 
 		 712 aa  817    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.81 
 
 		 688 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  67.93 
 
 		 715 aa  951    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  52.97 
 
 		 738 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.51 
 
 		 714 aa  1004    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  97.9 
 
 		 714 aa  1366    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.39 
 
 		 688 aa  836    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.55 
 
 		 688 aa  827    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  100 
 
 		 714 aa  1432    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.17 
 
 		 712 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  39.64 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  37.85 
 
 		 720 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  38.04 
 
 		 706 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 		 716 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  36.13 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.29 
 
 		 695 aa  357  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  37.34 
 
 		 698 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  33.7 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 705 aa  320  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 		 682 aa  319  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 705 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.57 
 
 		 706 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.26 
 
 		 707 aa  311  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 713 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 706 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 706 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 		 705 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 		 626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 730 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  30.74 
 
 		 706 aa  303  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.9 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.3 
 
 		 706 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 706 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 706 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 706 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 730 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 706 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 		 699 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 		 541 aa  287  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 741 aa  283  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 		 637 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  39.04 
 
 		 623 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  38.81 
 
 		 623 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 		 627 aa  279  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  29.26 
 
 		 704 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 		 637 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  29.82 
 
 		 779 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 		 638 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 638 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 		 636 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  37.17 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.85 
 
 		 638 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 		 541 aa  267  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  29.43 
 
 		 740 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 731 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 638 aa  267  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 		 639 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 		 636 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.67 
 
 		 634 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  46.49 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  43.01 
 
 		 633 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  33.49 
 
 		 646 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 		 645 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 		 568 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  33.08 
 
 		 646 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.05 
 
 		 626 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 		 619 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01109  methyl-accepting chemotaxis protein  32.66 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 674 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 		 638 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36 
 
 		 630 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 560 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.2 
 
 		 773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  46.05 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 		 540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  46.99 
 
 		 561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  42.74 
 
 		 634 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.96 
 
 		 632 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.25 
 
 		 634 aa  253  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  36.53 
 
 		 652 aa  253  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  33.96 
 
 		 632 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  43 
 
 		 561 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 		 638 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.6 
 
 		 628 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 		 622 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 		 541 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 628 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 		 640 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 		 638 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>