More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28870  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000145235  decreased coverage  0.000000000168739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  85.71 
 
 		 272 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  92.31 
 
 		 281 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  92.31 
 
 		 281 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  92.31 
 
 		 275 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  92.31 
 
 		 275 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  92.31 
 
 		 275 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  92.31 
 
 		 275 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  91.21 
 
 		 275 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  91.21 
 
 		 275 aa  140  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  90.7 
 
 		 303 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  61.54 
 
 		 284 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  58.24 
 
 		 281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3233  putative transposase protein  63.1 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  56.67 
 
 		 429 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  56.98 
 
 		 269 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  46.67 
 
 		 275 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  49.4 
 
 		 269 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  45.88 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  39.77 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  39.77 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  39.77 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  39.77 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  39.77 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  45.88 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  45.88 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  45.88 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  35.23 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  42.53 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  42.53 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  42.53 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  42.53 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  35.96 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  46.58 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0081  hypothetical protein  42.35 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.773542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  48.65 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  47.37 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  47.37 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  47.37 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  47.37 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  47.37 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  38.75 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  38.75 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  38.75 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  35.23 
 
 		 277 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  39.74 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  40.23 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1886  IS3 family transposase  48.98 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  36.25 
 
 		 386 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  36.25 
 
 		 386 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>