179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.67375e-13  decreased coverage  1.78046e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  114  4e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  114  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.65521e-14  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  114  4e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  88.24 
 
 
102 aa  114  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.41588e-11  hitchhiker  3.24729e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  88.24 
 
 
102 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  86.76 
 
 
102 aa  112  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  83.82 
 
 
102 aa  108  2e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  1.39324e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  75 
 
 
101 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.06319e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  76.47 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  71.01 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4695  ISPsy13, transposase OrfA  66.25 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  68.12 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  68.12 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  68.12 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3045  ISPsy12, transposase OrfA  77.42 
 
 
62 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.249443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  66.67 
 
 
102 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4797  hypothetical protein  93.75 
 
 
48 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  65.67 
 
 
99 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  65.67 
 
 
99 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  65.67 
 
 
99 aa  83.2  1e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  64.06 
 
 
99 aa  82  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2836  transposase IS3/IS911 family protein  65.15 
 
 
115 aa  81.3  4e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 
102 aa  81.3  4e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  60 
 
 
100 aa  73.2  1e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  55.88 
 
 
102 aa  72.4  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  55.88 
 
 
102 aa  72.4  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  55.88 
 
 
102 aa  72.4  2e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  51.52 
 
 
103 aa  70.5  8e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  2.70737e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4464  IS3 family transposase orfA  52.38 
 
 
103 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0436168  hitchhiker  0.00706078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0304  IS911 transposase orfA  52.38 
 
 
103 aa  68.9  2e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122708  hitchhiker  0.00078594 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.9  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
101 aa  68.6  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03524  transposase  50 
 
 
115 aa  68.6  3e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.329504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03475  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  68.6  3e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  54.55 
 
 
100 aa  67.8  5e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1100  IS911 transposase orfA  50 
 
 
103 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  54.55 
 
 
100 aa  67.4  6e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  51.47 
 
 
101 aa  67.4  6e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  54.69 
 
 
103 aa  67  9e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  50.77 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  66.2  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  66.2  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.57192e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.93736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.41055e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  50.77 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  50.77 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  50.77 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  50.77 
 
 
114 aa  65.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.9  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  53.03 
 
 
100 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>