More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
132 aa  277  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  98.47 
 
 
132 aa  273  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  80.15 
 
 
131 aa  236  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  74.81 
 
 
133 aa  214  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  64.12 
 
 
131 aa  187  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  64.12 
 
 
131 aa  186  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 
148 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 
131 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
131 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  60.31 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  60.31 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  62.02 
 
 
134 aa  176  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  66.94 
 
 
135 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 
133 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  60.15 
 
 
134 aa  174  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 
133 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  62.4 
 
 
136 aa  172  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
132 aa  173  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 
140 aa  168  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  62.5 
 
 
134 aa  167  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 
131 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 
131 aa  167  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
159 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
147 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  55.65 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
146 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  58.91 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  64.23 
 
 
131 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
151 aa  161  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  57.58 
 
 
136 aa  160  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 
140 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 
139 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 
135 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 
137 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 
140 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 
137 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
137 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
137 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
138 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
137 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 
132 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  57.98 
 
 
137 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 
135 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  63.48 
 
 
139 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 
139 aa  155  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 
138 aa  155  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  56.91 
 
 
136 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
177 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 
128 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 
166 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 
148 aa  154  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  55.3 
 
 
137 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 
163 aa  153  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  61.54 
 
 
143 aa  153  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  153  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  153  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
189 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 
137 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 
128 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  54.84 
 
 
128 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  61.34 
 
 
137 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  53.49 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
135 aa  151  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
136 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
142 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  53.85 
 
 
133 aa  150  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 
135 aa  151  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  52.67 
 
 
133 aa  150  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 
131 aa  150  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  56.25 
 
 
137 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
135 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.3 
 
 
159 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  59.83 
 
 
161 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 
137 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 
134 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  59.83 
 
 
143 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  59.83 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 
137 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 
137 aa  147  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
142 aa  147  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
137 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  59.13 
 
 
141 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  58.97 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 
156 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  58.97 
 
 
143 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  58.97 
 
 
143 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  58.97 
 
 
143 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>