More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  90.54 
 
 		 148 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  51.72 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  42.38 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  39.01 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  36.3 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  39.78 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.51 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.58 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  40.48 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.55 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.62 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.57 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.17 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  31.69 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.51 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  28.77 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.67 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  30.5 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  31.11 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.85 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.07 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  39.76 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  31.72 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.51 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  33.8 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  36.21 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  35.17 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.06 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.93 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.64 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.68 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  37.74 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  32.37 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.48 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.82 
 
 		 295 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  41.67 
 
 		 297 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  27.46 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.65 
 
 		 320 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.74 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  32.41 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  31.08 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  25.55 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.29 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.08 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  27.86 
 
 		 291 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  30.41 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  42.42 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  34 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.21 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.57 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.8 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  27.66 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.37 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  27.4 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.25 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.87 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  35.9 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  28.78 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.82 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>