225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  278  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  93.75 
 
 
144 aa  268  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  68.75 
 
 
144 aa  201  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  65 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  61.11 
 
 
151 aa  173  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  61.43 
 
 
148 aa  171  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  64.03 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  63.19 
 
 
144 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  60 
 
 
148 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  61.54 
 
 
145 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  57.75 
 
 
149 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  61.54 
 
 
145 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  60.84 
 
 
145 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  56.34 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  61.6 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  63.31 
 
 
147 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  63.89 
 
 
144 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  60.28 
 
 
149 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  60 
 
 
150 aa  148  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  58.04 
 
 
147 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  60.28 
 
 
150 aa  148  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  58.04 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  58.04 
 
 
147 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  57.34 
 
 
147 aa  146  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  61.81 
 
 
144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  61.43 
 
 
147 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  61.43 
 
 
147 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  61.43 
 
 
147 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  52.08 
 
 
146 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  61.19 
 
 
147 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  56.94 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  53.15 
 
 
148 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  57.24 
 
 
148 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  53.52 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  45.32 
 
 
149 aa  122  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  55 
 
 
146 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  47.1 
 
 
154 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  41.78 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  46.4 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  44.8 
 
 
174 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  36.73 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  46.43 
 
 
128 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  46.43 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  41.27 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  45.54 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  45.6 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  45.6 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  43.85 
 
 
173 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  45.6 
 
 
173 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  43.75 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  41.04 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  47.97 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  40.41 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.41 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  42.97 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  38.52 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  40.65 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  41.94 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  37.7 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  37.78 
 
 
378 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  49.57 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  56.67 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  39.26 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  35.92 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  39.55 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  36.43 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  39.52 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  44.19 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  37.39 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  36.8 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  34.51 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  34.68 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.1 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  39.37 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  39.37 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  39.37 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  33.59 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  39.71 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  39.6 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  44.35 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  33.83 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  32.56 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.29 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  33.59 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  31.75 
 
 
197 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  31.78 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  30.99 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  36.63 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  37.5 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.29 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  32.14 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  32.85 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>