More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  97.37 
 
 
608 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  76.48 
 
 
608 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  100 
 
 
608 aa  1254    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
609 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1728  long-chain-acyl-CoA synthetase  48.69 
 
 
612 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  43 
 
 
601 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  44.1 
 
 
600 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.42 
 
 
597 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3312  AMP-dependent synthetase and ligase  44.35 
 
 
592 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1163  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 
603 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.77 
 
 
592 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.6 
 
 
592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  43.6 
 
 
592 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  44.74 
 
 
598 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.3 
 
 
600 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2309  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.58 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  42.1 
 
 
592 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.67 
 
 
596 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.9 
 
 
630 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  41.22 
 
 
608 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  40.52 
 
 
593 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 
622 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1144  long-chain-acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 
590 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.036593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  38.51 
 
 
605 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.15 
 
 
610 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  39.2 
 
 
610 aa  346  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 
621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  34.88 
 
 
723 aa  284  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  35.3 
 
 
639 aa  256  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78107  predicted protein  32.41 
 
 
653 aa  243  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  31.31 
 
 
710 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.3 
 
 
545 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 
708 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
572 aa  160  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 
500 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 
500 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 
552 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
549 aa  154  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  34.02 
 
 
543 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.44 
 
 
538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  30.33 
 
 
512 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  27.04 
 
 
547 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
501 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  29.23 
 
 
502 aa  146  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 
512 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.29 
 
 
550 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  31.88 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 
551 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 
551 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.2 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.39 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.2 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 
522 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  32.7 
 
 
557 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.2 
 
 
517 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  29.62 
 
 
549 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.2 
 
 
517 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.19 
 
 
535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  24.95 
 
 
991 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.57 
 
 
509 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  24.13 
 
 
1005 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  24.13 
 
 
1005 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1267  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  23.75 
 
 
1005 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 
546 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.78 
 
 
517 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.78 
 
 
522 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 
517 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.28 
 
 
517 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
535 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.96 
 
 
534 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.78 
 
 
505 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  27.67 
 
 
532 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  25.78 
 
 
522 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
539 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.08 
 
 
522 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  23.96 
 
 
534 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11700  acyl-CoA synthetase  25.26 
 
 
999 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.257643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.59 
 
 
517 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.88 
 
 
522 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  23.89 
 
 
536 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  26.02 
 
 
538 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
568 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.77 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 
527 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  25.61 
 
 
503 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
807 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  23.65 
 
 
989 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3436  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 
586 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0569509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  26.26 
 
 
533 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4269  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 
539 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772082  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 
551 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  24.71 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  25.92 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.14 
 
 
518 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>