More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  90.09 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  30.33 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 
218 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
217 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 
217 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 
217 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 
217 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 
216 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 
216 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
228 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
228 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  30.43 
 
 
216 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 
222 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 
222 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
215 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 
212 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  31.9 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  31.19 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  32.38 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  29.65 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  30.43 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  28.86 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  31.19 
 
 
230 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  28.64 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  30.2 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  28.64 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  31.53 
 
 
214 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
241 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  29.15 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
222 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.7 
 
 
229 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  27.49 
 
 
210 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  31.66 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  33.89 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  30 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  30 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  30 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
221 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  31.19 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.49 
 
 
210 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.49 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  29.72 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  30.62 
 
 
219 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.57 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.85 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  27.96 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  26.98 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  27.96 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  28.5 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  27.96 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  26.96 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  27.52 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>