29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  717  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  95.71 
 
 
233 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  73.48 
 
 
233 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  72.34 
 
 
240 aa  304  2e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  71.93 
 
 
228 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  71.49 
 
 
228 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  72.17 
 
 
240 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  71.19 
 
 
236 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  43.28 
 
 
241 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  43.7 
 
 
241 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  54.27 
 
 
181 aa  145  8e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  47.22 
 
 
242 aa  135  1e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  39.22 
 
 
232 aa  133  4e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  40.55 
 
 
258 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  41.83 
 
 
238 aa  120  4e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  41.43 
 
 
255 aa  120  5e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  41.83 
 
 
238 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  40.24 
 
 
255 aa  115  1e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  40.98 
 
 
250 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  36.4 
 
 
257 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  39.81 
 
 
237 aa  112  8e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  37.34 
 
 
241 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  37.09 
 
 
229 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  39.32 
 
 
243 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  39.85 
 
 
275 aa  65.1  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  32.38 
 
 
263 aa  63.9  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  35.59 
 
 
275 aa  60.5  4e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  59.3  1e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  59.3  1e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>