More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  94.69 
 
 		 377 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  72.27 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  73.6 
 
 		 377 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  69.6 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  57.06 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  54.97 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  55.49 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  60.28 
 
 		 401 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  51.23 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  53.1 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  38.57 
 
 		 378 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  36.86 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  32.88 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  34.31 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  30.51 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.35 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  28.9 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.32 
 
 		 879 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 896 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  28.26 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  27.35 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.5 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.21 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  27.55 
 
 		 878 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.64 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  31.32 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.52 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.58 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.58 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  29.66 
 
 		 404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  28.83 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  31.65 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  28.17 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.4 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  27.61 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  29.09 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  33.54 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  29.01 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  28.2 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.39 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.21 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 380 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  25.85 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.95 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.03 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.03 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.03 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.22 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.22 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.03 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.22 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.03 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.12 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  28.16 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.22 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.39 
 
 		 885 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  26.75 
 
 		 880 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  26.38 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.73 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.01 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.73 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.92 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.5 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.22 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  27.79 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.41 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.73 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.28 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.88 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.08 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.38 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  27.46 
 
 		 420 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  26.36 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.02 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.83 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  26.99 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.43 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.13 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  29.91 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.98 
 
 		 641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.71 
 
 		 605 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.14 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.54 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 		 416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.44 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.38 
 
 		 407 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.15 
 
 		 414 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.66 
 
 		 774 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>