More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  96.21 
 
 		 343 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  79.29 
 
 		 344 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  45.1 
 
 		 337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 348 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  34.14 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  28.97 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.45 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  30.6 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  29.5 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 361 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1884  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0204154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  27.43 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.94 
 
 		 345 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  31.09 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.39 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05569  transcription regulator protein  27.22 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 352 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  30.55 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>