More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24675 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  97.38 
 
 
725 aa  690    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24675  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  82.27 
 
 
725 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  78.74 
 
 
730 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  77.59 
 
 
730 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  77.59 
 
 
730 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  78.16 
 
 
730 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  72.75 
 
 
762 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  72.48 
 
 
750 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  70.32 
 
 
756 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  74.5 
 
 
738 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  59.35 
 
 
721 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  59.69 
 
 
732 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.05 
 
 
725 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.21 
 
 
713 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  58.15 
 
 
722 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.55 
 
 
702 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.68 
 
 
702 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.68 
 
 
702 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.68 
 
 
702 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.68 
 
 
702 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.68 
 
 
702 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.11 
 
 
702 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.23 
 
 
702 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.23 
 
 
702 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  56.92 
 
 
702 aa  360  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.23 
 
 
702 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.92 
 
 
702 aa  360  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.92 
 
 
702 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  56.6 
 
 
702 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  56.6 
 
 
702 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.65 
 
 
738 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.19 
 
 
705 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  57.1 
 
 
707 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.62 
 
 
707 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  52.7 
 
 
752 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.99 
 
 
705 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.23 
 
 
706 aa  343  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.31 
 
 
707 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.88 
 
 
705 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.59 
 
 
707 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  54.29 
 
 
712 aa  341  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  54.26 
 
 
706 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  53.27 
 
 
706 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  54.26 
 
 
706 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.96 
 
 
711 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.44 
 
 
749 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.63 
 
 
701 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.23 
 
 
706 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.25 
 
 
708 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.16 
 
 
776 aa  331  9e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.84 
 
 
768 aa  330  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.23 
 
 
718 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.65 
 
 
699 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.79 
 
 
711 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.13 
 
 
718 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.11 
 
 
712 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.63 
 
 
734 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.63 
 
 
711 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.27 
 
 
708 aa  318  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.99 
 
 
724 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2125  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.99 
 
 
748 aa  315  6e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.842151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.65 
 
 
709 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.29 
 
 
713 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.29 
 
 
713 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  51.29 
 
 
713 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.33 
 
 
709 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.33 
 
 
709 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.17 
 
 
807 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.04 
 
 
711 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.82 
 
 
711 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.86 
 
 
712 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.33 
 
 
709 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.35 
 
 
711 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.33 
 
 
709 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  50.77 
 
 
734 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.06 
 
 
715 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.58 
 
 
711 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5734  oxidoreductase  49.53 
 
 
365 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  48.46 
 
 
768 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0981  putative RNA methylase  45.96 
 
 
751 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  43.22 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1014  THUMP domain protein  43.84 
 
 
760 aa  262  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.520443  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  43.65 
 
 
657 aa  259  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  44.77 
 
 
321 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  42.9 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2658  hypothetical protein  39.75 
 
 
325 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  33.85 
 
 
729 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  34.28 
 
 
398 aa  116  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  34.85 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  36.87 
 
 
297 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  31.83 
 
 
402 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  30.04 
 
 
385 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  30.88 
 
 
397 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  33.2 
 
 
318 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.14 
 
 
401 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  32.71 
 
 
398 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.62 
 
 
400 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.63 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  29.08 
 
 
493 aa  96.7  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>