218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24665 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_24665  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  98.46 
 
 
725 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  72.94 
 
 
725 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  79.69 
 
 
730 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  79.69 
 
 
730 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  77.78 
 
 
756 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  78.93 
 
 
730 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  78.16 
 
 
730 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  77.31 
 
 
750 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  76.92 
 
 
762 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  75.86 
 
 
738 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.13 
 
 
713 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  56.86 
 
 
738 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  55.12 
 
 
734 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  54.47 
 
 
712 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.3 
 
 
712 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  53.39 
 
 
725 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.62 
 
 
711 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.22 
 
 
721 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.35 
 
 
711 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.98 
 
 
713 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.98 
 
 
713 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.98 
 
 
713 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.15 
 
 
709 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.15 
 
 
709 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.15 
 
 
709 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.15 
 
 
709 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48 
 
 
707 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48 
 
 
707 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.37 
 
 
711 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.24 
 
 
709 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.28 
 
 
708 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.71 
 
 
711 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.18 
 
 
701 aa  236  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.49 
 
 
711 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.77 
 
 
752 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.87 
 
 
711 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.92 
 
 
732 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.06 
 
 
711 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.25 
 
 
718 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50.68 
 
 
705 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.32 
 
 
707 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.35 
 
 
705 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.84 
 
 
722 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.67 
 
 
749 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  49.77 
 
 
705 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.16 
 
 
699 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.36 
 
 
718 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.26 
 
 
712 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.7 
 
 
708 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.62 
 
 
706 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.62 
 
 
706 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.62 
 
 
706 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.85 
 
 
702 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  45.45 
 
 
702 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000372198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000581203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  45.45 
 
 
702 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000766949  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.45 
 
 
702 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.93 
 
 
715 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  46.83 
 
 
706 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  45.53 
 
 
391 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  42.8 
 
 
375 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  43.89 
 
 
389 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2125  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  47.99 
 
 
748 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.842151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.95 
 
 
702 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.5 
 
 
702 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.5 
 
 
702 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  48.51 
 
 
724 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.5 
 
 
702 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  45.5 
 
 
702 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  45.24 
 
 
729 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  43.46 
 
 
376 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  44.36 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  40.7 
 
 
706 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.7 
 
 
707 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  50.87 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  50.64 
 
 
387 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  50.87 
 
 
387 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  43.72 
 
 
393 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.77 
 
 
776 aa  189  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.02 
 
 
768 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  40.15 
 
 
375 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  45.71 
 
 
734 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.12 
 
 
807 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  43.32 
 
 
768 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  37.02 
 
 
375 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  37.02 
 
 
375 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  37.29 
 
 
387 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  47.16 
 
 
382 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1014  THUMP domain protein  37.98 
 
 
760 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.520443  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  40.49 
 
 
471 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  39.84 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  41.23 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  36.25 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  39.78 
 
 
380 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>