More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  95 
 
 		 340 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 345 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  73.04 
 
 		 357 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 341 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  71.39 
 
 		 346 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  71.1 
 
 		 346 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  68.6 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  68.02 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  39.78 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  40.83 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  31.04 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  32.33 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  32.02 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 364 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1230  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.593917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  31.83 
 
 		 354 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  29.3 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  30.2 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  26.65 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  24.71 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25.46 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  30.12 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  25.88 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  27.75 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>