More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_21800  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.44548e-06  normal  0.0953285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.87057e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0084  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150766  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t43  tRNA-Val  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0556993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0038  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0053  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0035  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309036  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0018  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0020  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0086  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.211919  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0069  tRNA-Val  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0543632  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t26  tRNA-Val  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t28  tRNA-Val  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  97.26 
 
 
76 bp  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  97.26 
 
 
76 bp  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  97.26 
 
 
76 bp  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  97.26 
 
 
76 bp  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R25  tRNA-Val  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112378  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0020  tRNA-Val  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  4.95031e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60430  tRNA-Val  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R27  tRNA-Val  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.23391e-05  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R36  tRNA-Val  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0061  tRNA-Val  95.89 
 
 
76 bp  121  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.03181 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0009  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  4.61705e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0062  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-1  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000143563  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0009  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.48453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0076  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0062  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0076  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Val-3  tRNA-Val  98.39 
 
 
76 bp  115  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2675  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000585827  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0879  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.26601e-05  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0911  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000875601  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2650  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.07401e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2674  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00824453  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0584  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.67929e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2966  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2967  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.52961e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0815  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.96983e-06  normal  0.877811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2676  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00067711  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2609  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.18351e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2610  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.40519e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2608  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.43017e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.89314e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0036  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.132949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5050  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  6.8764e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5049  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  6.03353e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4656  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90971e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5021  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  7.9938e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4683  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.66609e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4682  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.80923e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4681  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.95676e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5051  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  6.73895e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.78787e-09  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.93303e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.38872e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0769  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.6951e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0767  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  9.89037e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.60906e-08  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.83072e-08  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.67069e-09  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0038  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.27564e-09  hitchhiker  0.00122334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4658  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.12768e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2651  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.23066e-08  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00016  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.02389e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0059  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00482494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0058  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0040  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.37515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0039  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0038  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0054  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0053  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0052  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0060  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00525968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0035  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.134174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0037  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.140451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.72255e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00041  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.20834e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00042  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.23332e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.35072e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.21865e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.38641e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0057  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.77997e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0059  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.36722e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0033  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.39547e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0847  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  8.06074e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3636  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.30936e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3635  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.49841e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3634  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.79496e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0849  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.46237e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2781  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  6.34028e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.17876e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2780  tRNA-Val  94.52 
 
 
76 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  6.4612e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2561  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.77875e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2560  tRNA-Val  94.52 
 
 
78 bp  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.61237e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>