More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_23970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  59.45 
 
 		 748 aa  685    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  63.61 
 
 		 758 aa  752    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  74.4 
 
 		 645 aa  880    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  92.71 
 
 		 658 aa  1183    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 658 aa  1320    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  63.93 
 
 		 776 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  50.73 
 
 		 634 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  43.95 
 
 		 649 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  38.75 
 
 		 750 aa  425  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  41.85 
 
 		 655 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  37.71 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  38.31 
 
 		 673 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  36.61 
 
 		 681 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  37.74 
 
 		 662 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  36.51 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  37.87 
 
 		 654 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  37.22 
 
 		 666 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  37.71 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  35.52 
 
 		 697 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  37.9 
 
 		 654 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 705 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  35.1 
 
 		 703 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  35.31 
 
 		 686 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  35.31 
 
 		 686 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  35.31 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  35.31 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  34.18 
 
 		 710 aa  356  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  35.49 
 
 		 714 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  35 
 
 		 686 aa  353  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  35.23 
 
 		 700 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  35.23 
 
 		 700 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  34.15 
 
 		 705 aa  353  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  35.12 
 
 		 704 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  34.31 
 
 		 705 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  34.8 
 
 		 675 aa  352  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  34.64 
 
 		 672 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  34.09 
 
 		 706 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  36.29 
 
 		 703 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  34.36 
 
 		 704 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  35.44 
 
 		 702 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  34.48 
 
 		 789 aa  350  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  35.6 
 
 		 707 aa  350  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  34.09 
 
 		 724 aa  350  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  33.81 
 
 		 658 aa  349  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  34.85 
 
 		 710 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  35.11 
 
 		 703 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  36.54 
 
 		 670 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  34.96 
 
 		 660 aa  339  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  38.42 
 
 		 650 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  35.9 
 
 		 725 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  36.15 
 
 		 655 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  34.59 
 
 		 738 aa  332  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  34.62 
 
 		 674 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 640 aa  327  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  33.05 
 
 		 740 aa  323  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 783 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  32.74 
 
 		 787 aa  319  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  33.24 
 
 		 781 aa  319  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  33.24 
 
 		 781 aa  319  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  32.23 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  34.7 
 
 		 702 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  35.13 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 		 783 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  32.04 
 
 		 640 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  32.04 
 
 		 640 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  33.73 
 
 		 793 aa  310  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  31.95 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  29.57 
 
 		 803 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  33.76 
 
 		 753 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  34.11 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.52 
 
 		 744 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  29.76 
 
 		 807 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  31.61 
 
 		 757 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 757 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 750 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  34.71 
 
 		 736 aa  301  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 757 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 757 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 757 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  31.91 
 
 		 757 aa  299  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  34.7 
 
 		 641 aa  297  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  33.61 
 
 		 635 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  30.45 
 
 		 732 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  30.61 
 
 		 791 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  32.16 
 
 		 799 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  30.3 
 
 		 791 aa  287  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  35.04 
 
 		 584 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  33.05 
 
 		 630 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  32.77 
 
 		 648 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  32.82 
 
 		 774 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  33.56 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  32.99 
 
 		 632 aa  277  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  30.55 
 
 		 748 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  34.35 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  34.03 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.93 
 
 		 804 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  29.69 
 
 		 696 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  27.74 
 
 		 892 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>