More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  98.67 
 
 		 225 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  83.48 
 
 		 225 aa  370  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  82.14 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  81.7 
 
 		 225 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  82.14 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  82.14 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  81.7 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  80.8 
 
 		 225 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1806  DNA-binding response regulator  80.8 
 
 		 225 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3589  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  79.46 
 
 		 225 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110518  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  48.21 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  48.21 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 231 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  46.32 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.58 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  49.34 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  46.67 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  44.84 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.93 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  46.67 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  47.19 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  47.11 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  46.43 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  44.2 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  48.44 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.05 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.89 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.74 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  46.49 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  42.11 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.26 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  42.11 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  42.54 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.3 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.69 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1624  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  42.04 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  42.04 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  41.15 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  41.23 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  42.73 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  44.3 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.45 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.79 
 
 		 259 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  42.41 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.22 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3825  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.862228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>