More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  98.21 
 
 
446 aa  906    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  75.43 
 
 
465 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  81.61 
 
 
462 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  54.08 
 
 
479 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  45.27 
 
 
460 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  51.5 
 
 
738 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  46.1 
 
 
524 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  43.17 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  48.97 
 
 
662 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  44.69 
 
 
662 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  41.3 
 
 
529 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  43.32 
 
 
561 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  46.69 
 
 
532 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  45.11 
 
 
526 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  35.66 
 
 
472 aa  247  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  50.41 
 
 
516 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  40.18 
 
 
665 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 
696 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 
744 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  38.94 
 
 
758 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 
746 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.44 
 
 
611 aa  156  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.89 
 
 
694 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
1207 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
735 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.79 
 
 
757 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.94 
 
 
657 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.42 
 
 
656 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  37.72 
 
 
794 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  34.89 
 
 
518 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.63 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  35.77 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 
859 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  36.44 
 
 
752 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.92 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.9 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
864 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
701 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.96 
 
 
696 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.92 
 
 
729 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
903 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.09 
 
 
528 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
1093 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.8 
 
 
645 aa  143  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  36.28 
 
 
670 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 
861 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  35.45 
 
 
636 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
860 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.39 
 
 
701 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.17 
 
 
656 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.53 
 
 
518 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.17 
 
 
672 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.4 
 
 
936 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.3 
 
 
761 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.13 
 
 
815 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
858 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
822 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
702 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  34.31 
 
 
515 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 
817 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  34.04 
 
 
638 aa  136  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 
667 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 
911 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.34 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.57 
 
 
754 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.22 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.56 
 
 
678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.8 
 
 
879 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  34.01 
 
 
650 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 
632 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 
1156 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
744 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  34.2 
 
 
675 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.33 
 
 
737 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
652 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.52 
 
 
584 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.98 
 
 
753 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  36.19 
 
 
1172 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  33.74 
 
 
760 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.33 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 
741 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 
641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.41 
 
 
1180 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
681 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.31 
 
 
723 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.22 
 
 
723 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
641 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
593 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.55 
 
 
699 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.76 
 
 
483 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.33 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 
483 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  34.39 
 
 
758 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
759 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.16 
 
 
797 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  34.39 
 
 
758 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
756 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>