82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  52.32 
 
 
238 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  54.32 
 
 
259 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  54.59 
 
 
242 aa  248  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  54.04 
 
 
200 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  38.38 
 
 
200 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 
221 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  38.02 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  33.8 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 
221 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  33.18 
 
 
214 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  30.33 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  34.76 
 
 
207 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  35 
 
 
221 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  33.02 
 
 
210 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  35.18 
 
 
210 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
210 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
199 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  29.23 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  33.49 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
199 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.18 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  26.42 
 
 
209 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  27.83 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  29.29 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  24.27 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  33.01 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  22.8 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.13 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  23.36 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  22.75 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  31.37 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  20.77 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  24.47 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  24.88 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  30.89 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.89 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  29.56 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.61 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  26.6 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  27.96 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  23.76 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  29.38 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  24.12 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  26.6 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  25.5 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  23.33 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.33 
 
 
206 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.33 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.33 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.5 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.22 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  23.9 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  28.35 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  24.62 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  24.02 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  23.53 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  23.53 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  24.37 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  23.86 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.86 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  23.65 
 
 
211 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  23.65 
 
 
211 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  23.65 
 
 
211 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.15 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  24.89 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  21.93 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  21.03 
 
 
319 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.88 
 
 
336 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  37.33 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  24.21 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  23.9 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.38 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>