279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_22080  resolvase  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  56.96 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  48.29 
 
 
236 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  39.17 
 
 
237 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  37.83 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  38.3 
 
 
216 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 
224 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  36.91 
 
 
214 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  36.17 
 
 
228 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  40.43 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  35.32 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  34.76 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  35.32 
 
 
229 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  33.91 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  37.5 
 
 
223 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  36.53 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  33.04 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  33.05 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  32.62 
 
 
231 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  34.62 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  41.84 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  33.62 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  31.76 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  36.8 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  36.48 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  30.8 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  32.9 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  43.44 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  31.88 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  37.24 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  33.71 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  36.42 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  38.36 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  33.56 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.03 
 
 
295 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
380 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  31.18 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  32.12 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  30.95 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  31.17 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  30.32 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  29.22 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  33.12 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  33.12 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  29.87 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32.92 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  30.99 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  29.22 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.14 
 
 
462 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  31.68 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 
185 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  42.5 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 
580 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.89 
 
 
578 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 
186 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  35.86 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.63 
 
 
522 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  31.17 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  27.22 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.85 
 
 
511 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 
198 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  30.21 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  30.21 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  30.21 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  28.33 
 
 
597 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  31.13 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  32.93 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  31.08 
 
 
309 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  32.21 
 
 
185 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  28.4 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  33.1 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
190 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  30.46 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  27.93 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  31.82 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  30 
 
 
185 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  32.95 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.45 
 
 
558 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.87 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 
194 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  30.14 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  31.17 
 
 
188 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>