186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
84 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  2.71778e-11 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35130  cell division topological specificity factor MinE  79.76 
 
 
84 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.45463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  76.19 
 
 
84 aa  137  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  76.19 
 
 
84 aa  137  4e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  76.19 
 
 
84 aa  137  4e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  76.19 
 
 
84 aa  137  4e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  76.19 
 
 
84 aa  137  5e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3874  cell division topological specificity factor MinE  73.81 
 
 
84 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0810055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  73.81 
 
 
84 aa  134  3e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  71.43 
 
 
84 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1932  cell division topological specificity factor MinE  63.53 
 
 
85 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.55789e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0927  cell division topological specificity factor MinE  61.45 
 
 
83 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 
86 aa  112  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.16087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.38456e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.10514e-07  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.06409e-07  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.03577e-10  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  2.26469e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.38663e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  60 
 
 
85 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.4177e-09  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3025  cell division topological specificity factor MinE  62.2 
 
 
84 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  57.65 
 
 
86 aa  109  1e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.16075e-09  hitchhiker  2.19314e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  58.33 
 
 
86 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.4687e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
86 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.25931e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  57.65 
 
 
86 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.81978e-06  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01606  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
86 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.38855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3068  cell division topological specificity factor MinE  60.24 
 
 
93 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.92069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  59.3 
 
 
88 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.60845e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1836  cell division topological specificity factor MinE  56.63 
 
 
85 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000758675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  59.52 
 
 
94 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1659  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.95345e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2337  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
83 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1318  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.49629e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2474  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1274  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.36867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01159  hypothetical protein  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2451  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013446  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1975  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220413  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01149  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1327  cell division topological specificity factor MinE  65.48 
 
 
88 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000455386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
85 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2015  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
88 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00111528  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1317  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
88 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.76449e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1501  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
88 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00311098  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1958  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
88 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  7.38777e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1955  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
88 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00065968  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2373  cell division topological specificity factor MinE  64.29 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116019  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
96 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1589  cell division topological specificity factor MinE  54.65 
 
 
93 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.227403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2352  cell division topological specificity factor MinE  58.33 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0614704  normal  0.0900841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  48.81 
 
 
84 aa  96.7  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.3438e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  54.65 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1995  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0206269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1938  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  1.67283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2008  cell division topological specificity factor MinE  60.71 
 
 
94 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2234  cell division topological specificity factor MinE  59.52 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.01972e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2758  cell division topological specificity factor MinE  57.14 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  7.33452e-11  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1547  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.49363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04465  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  46.99 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0596  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
85 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.926303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0034  cell division topological specificity factor MinE  56.47 
 
 
87 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  49.4 
 
 
83 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  49.4 
 
 
83 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2012  cell division topological specificity factor MinE  55.95 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.22247e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2401  cell division topological specificity factor MinE  55.95 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.42715e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2123  cell division topological specificity factor MinE  55.95 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0678  cell division topological specificity factor MinE  50.6 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2583  cell division topological specificity factor MinE  52.87 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  87.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0093  cell division topological specificity factor MinE  55.29 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1094  cell division topological specificity factor MinE  48.19 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0018  cell division topological specificity factor MinE  54.22 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62898  normal  0.229437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0086  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0067  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0126  cell division topological specificity factor MinE  53.57 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1065  cell division topological specificity factor MinE  54.76 
 
 
86 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00330436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004088  cell division topological specificity factor MinE  54.12 
 
 
87 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.45291e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  49.41 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  83.6  1e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1634  cell division topological specificity factor MinE  53.57 
 
 
88 aa  83.2  1e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
84 aa  82.4  2e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0033  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  82.4  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0062  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  82.4  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.301009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0985  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.520156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  51.76 
 
 
88 aa  82  3e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0945  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3239  cell division topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4089  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311155  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1056  cell division topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
84 aa  82  3e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3563  cell division topological specificity factor MinE  51.81 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0506  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  81.6  3e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.942785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  48.84 
 
 
92 aa  82  3e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  53.01 
 
 
84 aa  81.3  4e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>