More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4514  patatin  72.6 
 
 		 751 aa  1082    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  72.88 
 
 		 728 aa  1086    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  74.31 
 
 		 733 aa  1071    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  73.71 
 
 		 727 aa  1084    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  95.74 
 
 		 728 aa  1373    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  72.47 
 
 		 728 aa  1073    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  71.74 
 
 		 728 aa  1072    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1462    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  40.67 
 
 		 745 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.29 
 
 		 750 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.52 
 
 		 777 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  37.62 
 
 		 748 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.13 
 
 		 741 aa  422  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.92 
 
 		 738 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.66 
 
 		 738 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  32.52 
 
 		 738 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.66 
 
 		 737 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  33.33 
 
 		 738 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.88 
 
 		 738 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  33.11 
 
 		 736 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  34.12 
 
 		 734 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  33.98 
 
 		 735 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.66 
 
 		 738 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  33.29 
 
 		 738 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  33.02 
 
 		 739 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  32.39 
 
 		 737 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  32.18 
 
 		 751 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  34.07 
 
 		 737 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.85 
 
 		 735 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  34.49 
 
 		 790 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.2 
 
 		 754 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.06 
 
 		 767 aa  360  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  34.29 
 
 		 920 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  34.29 
 
 		 930 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.87 
 
 		 852 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  34.16 
 
 		 728 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  34.16 
 
 		 933 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  34.16 
 
 		 945 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  32.3 
 
 		 776 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.56 
 
 		 753 aa  342  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  34.03 
 
 		 714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  32.16 
 
 		 771 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  32.75 
 
 		 745 aa  332  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.92 
 
 		 667 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.1 
 
 		 764 aa  319  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  32.43 
 
 		 813 aa  319  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.25 
 
 		 804 aa  317  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.51 
 
 		 798 aa  316  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  31.56 
 
 		 796 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.22 
 
 		 803 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.22 
 
 		 803 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  30.29 
 
 		 729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.09 
 
 		 803 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.79 
 
 		 733 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  36.46 
 
 		 760 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  42.19 
 
 		 746 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  34.52 
 
 		 740 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  38.18 
 
 		 740 aa  214  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  33.25 
 
 		 720 aa  205  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  38.38 
 
 		 707 aa  204  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  41.5 
 
 		 950 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  34.15 
 
 		 981 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  40.14 
 
 		 923 aa  193  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.09 
 
 		 900 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  37.67 
 
 		 894 aa  184  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  38.78 
 
 		 875 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  33.14 
 
 		 775 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  37.29 
 
 		 909 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  38.82 
 
 		 311 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.28 
 
 		 306 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.28 
 
 		 305 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.28 
 
 		 305 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  36.33 
 
 		 260 aa  171  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  40 
 
 		 358 aa  170  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.98 
 
 		 302 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  38.35 
 
 		 308 aa  168  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36.36 
 
 		 263 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.29 
 
 		 323 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.63 
 
 		 302 aa  167  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.97 
 
 		 256 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.31 
 
 		 275 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  37.01 
 
 		 317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.76 
 
 		 315 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  37.91 
 
 		 311 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.99 
 
 		 349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  35.31 
 
 		 323 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  36.46 
 
 		 263 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.71 
 
 		 323 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.15 
 
 		 347 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.82 
 
 		 358 aa  163  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.81 
 
 		 306 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.82 
 
 		 474 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  36.46 
 
 		 263 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.81 
 
 		 347 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  35.81 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  38.18 
 
 		 316 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  37.5 
 
 		 302 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.46 
 
 		 330 aa  161  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  36.11 
 
 		 333 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.88 
 
 		 272 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>