257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  764  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  96.29 
 
 
377 aa  744  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  50.67 
 
 
379 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  33.23 
 
 
780 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  28.9 
 
 
383 aa  146  4e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
378 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  28.09 
 
 
405 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
367 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
384 aa  133  4e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  28.12 
 
 
383 aa  122  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 
382 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
392 aa  120  4e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 
395 aa  120  4e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
383 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 
381 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 
379 aa  118  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  27.54 
 
 
383 aa  118  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  27.54 
 
 
383 aa  118  2e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
383 aa  118  2e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
397 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  27.25 
 
 
378 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 
381 aa  115  9e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
384 aa  115  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  27.54 
 
 
386 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  30.55 
 
 
375 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  27.81 
 
 
382 aa  109  8e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  26.15 
 
 
381 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  25.07 
 
 
397 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
381 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  24.59 
 
 
395 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
496 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  25.2 
 
 
293 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 
376 aa  84.3  3e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  29.84 
 
 
390 aa  82  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.88 
 
 
375 aa  82  2e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
390 aa  79.3  1e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.25 
 
 
399 aa  78.2  2e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  29.51 
 
 
390 aa  77.8  3e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 
397 aa  77.4  4e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.15 
 
 
379 aa  76.3  8e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.12 
 
 
382 aa  76.3  8e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.23 
 
 
415 aa  76.3  9e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  27.57 
 
 
491 aa  75.5  1e-12  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
387 aa  73.9  4e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
395 aa  73.6  5e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.08 
 
 
379 aa  72.8  9e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
429 aa  72  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.35 
 
 
384 aa  72.4  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.08 
 
 
376 aa  72  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 
367 aa  71.2  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 
431 aa  70.9  3e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.61 
 
 
434 aa  71.2  3e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 
371 aa  70.9  4e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 
381 aa  70.5  5e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
390 aa  70.5  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 
370 aa  69.7  7e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.57 
 
 
378 aa  69.7  8e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  24 
 
 
383 aa  69.3  9e-11  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 
378 aa  69.3  9e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 
369 aa  69.3  9e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  24.07 
 
 
373 aa  68.9  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.55 
 
 
375 aa  68.9  1e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  26.23 
 
 
435 aa  69.3  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
387 aa  68.6  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 
376 aa  68.6  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 
370 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  26.22 
 
 
372 aa  68.6  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  27.39 
 
 
370 aa  67.8  3e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
429 aa  67.4  4e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
372 aa  66.2  9e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  27 
 
 
405 aa  65.9  1e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  28.3 
 
 
395 aa  65.9  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.16 
 
 
382 aa  65.9  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.14 
 
 
391 aa  65.9  1e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 
390 aa  65.9  1e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
430 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
384 aa  65.1  2e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 
417 aa  65.1  2e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
378 aa  65.1  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
368 aa  65.1  2e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 
391 aa  63.9  5e-09  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
372 aa  63.5  5e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.61 
 
 
381 aa  63.5  6e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.1 
 
 
382 aa  62.4  1e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 
366 aa  62.4  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 
373 aa  62.4  1e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
405 aa  62.4  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
384 aa  62  1e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 
381 aa  61.6  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
430 aa  61.6  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 
408 aa  61.6  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.7 
 
 
380 aa  60.8  3e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 
373 aa  61.2  3e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.65 
 
 
374 aa  61.2  3e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
380 aa  60.5  4e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
380 aa  60.8  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 
378 aa  60.5  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  28.5 
 
 
380 aa  60.1  6e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>