238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  96.4 
 
 		 390 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  53.35 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.25 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  30.03 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  28.14 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.7 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 780 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.9 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.12 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  28.28 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.13 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.41 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  30.16 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.9 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  29.51 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  23.91 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  23.55 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  23.44 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.08 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  24.68 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.51 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  23.96 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  26.28 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  27.14 
 
 		 942 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  25.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  35.4 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.85 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.05 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  24.06 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.1 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  25.49 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  25.74 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.17 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  21.93 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  24.53 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  24.53 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  24.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  24.53 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  24.53 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.99 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  24.23 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  23.94 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.58 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  23.82 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  22.29 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.57 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  24.54 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  24.22 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  42.65 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.28 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  24.92 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  42.65 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  37.78 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>