More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19800 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  99.19 
 
 		 294 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  66.4 
 
 		 271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  65.59 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 274 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  62.75 
 
 		 274 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 269 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  29.41 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  28.36 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  30.21 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 385 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.82 
 
 		 1296 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0179  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 388 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0264145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 492 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.59 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0345  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  31.4 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 364 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.93 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0359  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.524425  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 377 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.1 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 934 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 791 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 315 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  34.31 
 
 		 380 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 367 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 745 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 745 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 322 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 381 aa  52  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  30.23 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  28.26 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 333 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 340 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>