More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  73.23 
 
 
476 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  93.59 
 
 
468 aa  856    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  71.31 
 
 
468 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  73.23 
 
 
475 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  73.66 
 
 
468 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  73.29 
 
 
475 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  73.23 
 
 
468 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  931    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
491 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
491 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 
491 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
469 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  47.65 
 
 
489 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 
472 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  45.91 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  45.34 
 
 
493 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
462 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 
466 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 
463 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 
460 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 
462 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  42.33 
 
 
466 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
456 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
456 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
454 aa  289  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  40.13 
 
 
480 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
462 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
456 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  40.96 
 
 
460 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  40.96 
 
 
460 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 
472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
460 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
482 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
456 aa  199  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  33.48 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.15 
 
 
463 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
463 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
463 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
459 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 
457 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.33 
 
 
463 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.7 
 
 
464 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  31.26 
 
 
462 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
472 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
443 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
521 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
462 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
491 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  31.26 
 
 
462 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
468 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
468 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
464 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.63 
 
 
465 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  33.33 
 
 
465 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.79 
 
 
465 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
480 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
477 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
466 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
462 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
486 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  30.16 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.7 
 
 
470 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.82 
 
 
430 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.96 
 
 
466 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
428 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
473 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
430 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
435 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  32.05 
 
 
466 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
482 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
477 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
465 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
434 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
434 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  31.63 
 
 
470 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
434 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
429 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
483 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
482 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  30.99 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.55 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
435 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>