More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19630 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  99.46 
 
 
186 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
186 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  86.56 
 
 
187 aa  343  9e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  85.48 
 
 
187 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  86.56 
 
 
186 aa  338  3e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  85.48 
 
 
186 aa  332  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  80.98 
 
 
186 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  80.98 
 
 
186 aa  321  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  80.43 
 
 
186 aa  320  1e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  81.56 
 
 
181 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  81.56 
 
 
181 aa  308  3e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  81.56 
 
 
181 aa  306  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  81.01 
 
 
181 aa  304  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  80.45 
 
 
181 aa  303  1e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  81.01 
 
 
181 aa  301  3e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  80.9 
 
 
181 aa  301  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  80.9 
 
 
181 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  75.82 
 
 
184 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  75.96 
 
 
198 aa  291  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  6.26036e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  79.89 
 
 
181 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  79.89 
 
 
190 aa  284  6e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  79.33 
 
 
181 aa  283  1e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  73.08 
 
 
189 aa  281  3e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  73.08 
 
 
185 aa  279  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  67.93 
 
 
184 aa  275  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  67.6 
 
 
182 aa  268  3e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  66.85 
 
 
179 aa  263  9e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  65.36 
 
 
181 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  64.84 
 
 
188 aa  260  7e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  64.84 
 
 
184 aa  260  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  70.22 
 
 
200 aa  253  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  65.17 
 
 
180 aa  253  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  61.96 
 
 
185 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  67.82 
 
 
179 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  67.82 
 
 
179 aa  248  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 
203 aa  246  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  66.47 
 
 
235 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  66.08 
 
 
247 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
235 aa  243  1e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  63.58 
 
 
235 aa  243  2e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
239 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  64.16 
 
 
239 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  61.45 
 
 
212 aa  240  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  58.7 
 
 
213 aa  237  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  59.12 
 
 
243 aa  236  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  61.27 
 
 
213 aa  235  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  58.52 
 
 
216 aa  234  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  60.8 
 
 
218 aa  233  1e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  61.36 
 
 
199 aa  233  2e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 
226 aa  230  8e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  60.44 
 
 
193 aa  230  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
214 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
214 aa  229  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 
219 aa  228  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 
218 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 
201 aa  227  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  9.98174e-12  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  60.82 
 
 
219 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  57.22 
 
 
223 aa  225  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  60.12 
 
 
223 aa  225  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  60.69 
 
 
201 aa  225  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
220 aa  224  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 
190 aa  225  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  57.87 
 
 
203 aa  223  8e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  59.54 
 
 
270 aa  222  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 
210 aa  222  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  59.44 
 
 
195 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  56.11 
 
 
202 aa  222  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 
216 aa  222  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 
203 aa  221  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  58.19 
 
 
190 aa  222  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 
190 aa  221  5e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  59.06 
 
 
190 aa  219  1e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
195 aa  218  4e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 
199 aa  218  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 
179 aa  216  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  56.74 
 
 
435 aa  216  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  59.52 
 
 
193 aa  214  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 
190 aa  215  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 
190 aa  214  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 
194 aa  214  7e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  56.11 
 
 
329 aa  213  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  52.25 
 
 
186 aa  210  8e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
226 aa  204  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 
224 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  57.06 
 
 
206 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 
225 aa  194  4e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
193 aa  194  5e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 
213 aa  194  8e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
194 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52 
 
 
213 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
207 aa  190  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 
199 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 
210 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  51.98 
 
 
205 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  52.57 
 
 
200 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 
242 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  50.85 
 
 
198 aa  184  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  54.07 
 
 
185 aa  184  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.39263e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  54.02 
 
 
195 aa  184  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  52.33 
 
 
188 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>