More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  85.56 
 
 
180 aa  320  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  54.6 
 
 
192 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  49.11 
 
 
175 aa  164  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.71 
 
 
177 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.37 
 
 
188 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  41.76 
 
 
194 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  43.02 
 
 
173 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  41.86 
 
 
177 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.51 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  38.69 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.44 
 
 
184 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.72 
 
 
212 aa  120  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  36.46 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  36.57 
 
 
173 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  38.78 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  39.46 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  35.91 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  35.26 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  37.85 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  35.43 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.07 
 
 
178 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  37.29 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  39.31 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  35.12 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  33.53 
 
 
176 aa  110  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  37.29 
 
 
183 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  34.86 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  35.43 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  34.86 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.88 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  35.47 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  34.29 
 
 
173 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  35.2 
 
 
390 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.29 
 
 
173 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  39.89 
 
 
180 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  37.43 
 
 
177 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
177 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  35.84 
 
 
199 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  43.45 
 
 
178 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
207 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
182 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
178 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  38.76 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
176 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.42 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  35.09 
 
 
181 aa  97.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  35.84 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
177 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.75 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.3 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  34.03 
 
 
191 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.09 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  32.95 
 
 
196 aa  90.9  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.66 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  31.25 
 
 
175 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
178 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.52 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  35.42 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.56 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.64 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.96 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.02 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.08 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  32.29 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  34.91 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.9 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  27.53 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15710  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.48 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3982  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.19 
 
 
341 aa  71.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.21 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  29.19 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.68 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.21 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.68 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  28.82 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.83 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  32.77 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.41 
 
 
386 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.03 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>