105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  93.44 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  84.84 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  85.25 
 
 		 244 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  71.19 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  71.19 
 
 		 244 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  66.67 
 
 		 244 aa  344  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  67.62 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  65.16 
 
 		 244 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  50.21 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  50.83 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  36.93 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  41.56 
 
 		 964 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  34.3 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  38.2 
 
 		 972 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  41.15 
 
 		 998 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  33.06 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  39.47 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  40.09 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  34.6 
 
 		 977 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  42.27 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  34.8 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.75 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  38.6 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  32.93 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.56 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  32.59 
 
 		 891 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  31.23 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  35.39 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  33.14 
 
 		 287 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  29.66 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  32.23 
 
 		 748 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.73 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  29.5 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  27.22 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  30.59 
 
 		 770 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.92 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.46 
 
 		 736 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  34.68 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 768 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  27.03 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.94 
 
 		 767 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  35.9 
 
 		 376 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.23 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 384 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 384 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 366 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 		 391 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 380 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 378 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.71 
 
 		 379 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 391 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 375 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.5 
 
 		 366 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  32.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.07 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  31.48 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.8 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  30.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  30.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  30.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  30.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  30.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 375 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  29.27 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 383 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.88 
 
 		 365 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  34.44 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  32.23 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  35.16 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>