More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
301 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  97.12 
 
 
301 aa  550  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  73.74 
 
 
307 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  72.08 
 
 
286 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  72.66 
 
 
307 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  68.04 
 
 
298 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  71.69 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  70.5 
 
 
307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  64.81 
 
 
298 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  65.62 
 
 
297 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  66.04 
 
 
295 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  44.62 
 
 
267 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  41.6 
 
 
296 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  40.68 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  33.9 
 
 
282 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  36.43 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  37.93 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  31.03 
 
 
292 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  31.14 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  34.13 
 
 
276 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  32.07 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  32.07 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  32.07 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  32.07 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  32.07 
 
 
284 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  32.07 
 
 
284 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  32.07 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  32.07 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 
285 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.65 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.77 
 
 
287 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  31.39 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  33.33 
 
 
278 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  29.35 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  40.94 
 
 
307 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  30.71 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  40.94 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  29.31 
 
 
270 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  38.6 
 
 
295 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.94 
 
 
282 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  27.63 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  29.91 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  28.47 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  29.69 
 
 
303 aa  89  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  28.35 
 
 
265 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  29.43 
 
 
324 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  28.47 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  31.45 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.65 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  31.77 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.89 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  32.41 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  31.67 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.33 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  31.23 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  29.45 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.14 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  34.68 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  27.42 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  28.47 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  31.58 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  27.05 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.72 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  31.46 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  29.53 
 
 
274 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.2 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  24.8 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  30.05 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  28.86 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  33.63 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  28.28 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.04 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.21 
 
 
277 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  29.41 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  24.28 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  27.12 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  38.66 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  24.43 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.22 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.05 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  36.13 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.54 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  31.9 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.45 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.44 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  34.07 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  24.33 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.62 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  27.57 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  27.31 
 
 
413 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.21 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  28.95 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.27 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  27.56 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>