123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  98.39 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  77.87 
 
 
248 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  72.95 
 
 
248 aa  349  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  63.68 
 
 
262 aa  323  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  70.56 
 
 
264 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  69.7 
 
 
264 aa  314  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  70.13 
 
 
264 aa  314  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  69.66 
 
 
262 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  69.7 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  69.7 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  70.56 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  70.56 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  69.26 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  70.56 
 
 
264 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  70.13 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  70.13 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  68.38 
 
 
242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  58.37 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  57.96 
 
 
259 aa  301  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  56.15 
 
 
261 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  56.79 
 
 
267 aa  286  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  61.44 
 
 
266 aa  286  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  60.85 
 
 
267 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  61.76 
 
 
327 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  61.16 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  60.94 
 
 
263 aa  281  9e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  56.84 
 
 
251 aa  279  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  57.98 
 
 
272 aa  278  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  61.98 
 
 
264 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  56.45 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  60.85 
 
 
260 aa  269  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  60.43 
 
 
260 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  60.85 
 
 
260 aa  269  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  60.85 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  60 
 
 
260 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  60 
 
 
263 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  60 
 
 
260 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  58.55 
 
 
291 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  60 
 
 
260 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  58.55 
 
 
244 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  56.9 
 
 
338 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  56.41 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  56.85 
 
 
336 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  55.7 
 
 
277 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  56.02 
 
 
265 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  56.49 
 
 
267 aa  248  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  55.6 
 
 
265 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  51.9 
 
 
275 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  57.56 
 
 
256 aa  242  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  57.85 
 
 
262 aa  238  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  59.2 
 
 
226 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  59.2 
 
 
226 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  51.32 
 
 
234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  50.44 
 
 
233 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  43.17 
 
 
225 aa  192  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  42.54 
 
 
316 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  43.86 
 
 
228 aa  185  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  39.13 
 
 
340 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  43.11 
 
 
229 aa  175  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  46.49 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  45.61 
 
 
253 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  41.15 
 
 
218 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  46.22 
 
 
269 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  45.33 
 
 
319 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  40.18 
 
 
225 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  37.95 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  36.12 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  35.56 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  36.89 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  33.04 
 
 
305 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  36.07 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  34.19 
 
 
220 aa  118  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  33.65 
 
 
224 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  32.31 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  34.45 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  35.75 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  34.45 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  34.03 
 
 
247 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  36.32 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  36.28 
 
 
225 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  36.74 
 
 
225 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  35.37 
 
 
221 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  37.24 
 
 
263 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  38.28 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  38.64 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  31.72 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.19 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  35 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  30.97 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  30.97 
 
 
220 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  30.77 
 
 
233 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  32.76 
 
 
231 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  34.93 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  31.22 
 
 
349 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  32.88 
 
 
222 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  28.26 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  34.13 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  30.41 
 
 
223 aa  82  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>