78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  91.7 
 
 		 229 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  56.09 
 
 		 221 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  56.33 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  63.64 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  54.59 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  55.45 
 
 		 215 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  60.44 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  56.89 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  42.36 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  42.36 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  42.36 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  42.34 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  42.48 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  41.05 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  41.48 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  40.81 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  40.52 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  37.83 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  37.83 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  37.83 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  37.83 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  37.5 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  39.74 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  38.67 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  37.71 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  27.91 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  32.65 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  32.65 
 
 		 253 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  40.82 
 
 		 201 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  40.82 
 
 		 201 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.08 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.1 
 
 		 163 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.85 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  23.93 
 
 		 183 aa  52  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  29.14 
 
 		 152 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  29.14 
 
 		 152 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  25.36 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  25.74 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  24.63 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  22.37 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  25 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  26.39 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  25.71 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  23.42 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  24.44 
 
 		 148 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  26.17 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  24.29 
 
 		 146 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.47 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  24.06 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  29.36 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  23.49 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  34.43 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0080  CheW protein  22.45 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0672928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  22.3 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  28.17 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  30.34 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  23.26 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  24 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  27.92 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.28 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  22.3 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  22.22 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  26.28 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  24.43 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  24 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.54 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.32 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.54 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  25.83 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  21.19 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.98 
 
 		 312 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  37.88 
 
 		 179 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  34.34 
 
 		 212 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  28.26 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>