16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15560 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15560  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000160918  unclonable  2.1203199999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3351  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 239 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00224637  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6595  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  79.41 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00498827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2291  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  79.41 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419933  normal  0.142796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5510  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  79.41 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  58.82 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5834  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  51.92 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  51.92 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2219  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  55.77 
 
 		 98 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>