More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.21893e-05  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  96.77 
 
 
186 aa  360  5e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  90.81 
 
 
186 aa  340  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  88.17 
 
 
186 aa  338  3e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  88.17 
 
 
186 aa  338  3e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  88.17 
 
 
186 aa  334  4e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  1.07923e-05 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 
185 aa  334  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 
185 aa  334  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 
185 aa  334  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  89.19 
 
 
185 aa  334  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  88.65 
 
 
185 aa  332  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  88.17 
 
 
186 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  88.17 
 
 
186 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  87.57 
 
 
185 aa  330  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  87.57 
 
 
205 aa  327  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  87.57 
 
 
186 aa  323  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  85.41 
 
 
201 aa  320  1e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  85.41 
 
 
201 aa  320  1e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  76.34 
 
 
188 aa  285  3e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  76.5 
 
 
188 aa  284  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  70.65 
 
 
184 aa  276  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  70.65 
 
 
188 aa  273  1e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  70.49 
 
 
192 aa  268  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  71.67 
 
 
189 aa  265  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  68.72 
 
 
235 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  62.9 
 
 
191 aa  243  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  7.53359e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  68.67 
 
 
183 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  62.57 
 
 
200 aa  227  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  88.28 
 
 
129 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  56.99 
 
 
188 aa  220  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.29 
 
 
184 aa  219  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.57012e-12  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  61.54 
 
 
187 aa  214  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  54.05 
 
 
192 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.08 
 
 
187 aa  201  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  3.64698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  53.04 
 
 
188 aa  178  5e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  52.49 
 
 
188 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  46.33 
 
 
183 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  45.81 
 
 
207 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  42.94 
 
 
190 aa  134  6e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40.22 
 
 
189 aa  133  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
194 aa  131  7e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
185 aa  129  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  41.3 
 
 
188 aa  128  4e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.23 
 
 
192 aa  127  7e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.59 
 
 
205 aa  126  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.59 
 
 
205 aa  126  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  45.8 
 
 
137 aa  126  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 
188 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.77256e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.92 
 
 
198 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.02686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.23 
 
 
190 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 
185 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
188 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
197 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
197 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.98 
 
 
199 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.74 
 
 
203 aa  120  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.15 
 
 
190 aa  119  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.15 
 
 
190 aa  119  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.15 
 
 
190 aa  119  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
187 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
195 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.78 
 
 
188 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  8.35062e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 
188 aa  118  4e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 
180 aa  118  4e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.96 
 
 
190 aa  118  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.78 
 
 
187 aa  118  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31801e-20 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  39.18 
 
 
188 aa  118  4e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  41.67 
 
 
184 aa  118  5e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.56 
 
 
184 aa  118  5e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.59 
 
 
188 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.11 
 
 
228 aa  117  8e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
191 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40.76 
 
 
198 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.66 
 
 
182 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
199 aa  117  1e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
199 aa  117  1e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.4 
 
 
197 aa  117  1e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.44 
 
 
188 aa  117  1e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  41.76 
 
 
186 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
199 aa  117  1e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
194 aa  116  2e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  2.35811e-06 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 
180 aa  116  2e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.89 
 
 
197 aa  116  2e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 
206 aa  116  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  35.71 
 
 
181 aa  116  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.7 
 
 
205 aa  116  2e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 
186 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  3.18958e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.51 
 
 
205 aa  115  4e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
196 aa  114  7e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.2 
 
 
218 aa  114  7e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  41.11 
 
 
184 aa  114  8e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.38 
 
 
196 aa  114  8e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.89 
 
 
185 aa  114  8e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  41.11 
 
 
184 aa  114  8e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.33 
 
 
185 aa  113  1e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  39.78 
 
 
193 aa  114  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 
290 aa  114  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
185 aa  114  1e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>