More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  73.12 
 
 
688 aa  1036    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  73.27 
 
 
688 aa  1037    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  61.85 
 
 
745 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  72.69 
 
 
688 aa  1028    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  57.42 
 
 
676 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  62.42 
 
 
687 aa  823    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  61.68 
 
 
713 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  61.85 
 
 
745 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  61.85 
 
 
745 aa  823    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  56.02 
 
 
681 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  62.31 
 
 
749 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  71.35 
 
 
710 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  49.7 
 
 
691 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  61.36 
 
 
710 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.4 
 
 
725 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  62.65 
 
 
753 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  59.68 
 
 
684 aa  817    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  62.2 
 
 
745 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  57.56 
 
 
698 aa  734    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  63.85 
 
 
726 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  55.88 
 
 
681 aa  786    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  57.93 
 
 
687 aa  781    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  98.61 
 
 
719 aa  1462    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  61.67 
 
 
710 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  62.22 
 
 
749 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  55.18 
 
 
724 aa  756    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  58.22 
 
 
669 aa  787    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  56.02 
 
 
686 aa  787    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  61.67 
 
 
710 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  72.54 
 
 
688 aa  1034    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  57.27 
 
 
676 aa  783    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  62.27 
 
 
709 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  100 
 
 
723 aa  1490    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  61.67 
 
 
710 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  46.62 
 
 
686 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.51 
 
 
662 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.63 
 
 
661 aa  439  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  40.39 
 
 
667 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  38.96 
 
 
663 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  39.19 
 
 
668 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 
668 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  38.89 
 
 
668 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  36.86 
 
 
667 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.74 
 
 
695 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 
672 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.36 
 
 
665 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
697 aa  239  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
699 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
681 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 
668 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.46 
 
 
699 aa  162  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
702 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
702 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
760 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 
661 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 
768 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
673 aa  140  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 
718 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 
696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
793 aa  110  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
684 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 
698 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
708 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  25.96 
 
 
701 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 
705 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
713 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.84 
 
 
625 aa  102  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
713 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  23.37 
 
 
708 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
716 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
713 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
780 aa  95.5  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 
775 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 
713 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
705 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
714 aa  90.9  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
685 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 
750 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
769 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  25.94 
 
 
712 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.31 
 
 
750 aa  82.4  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 
729 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
741 aa  79  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
683 aa  78.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  48.61 
 
 
185 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.3 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
721 aa  77.4  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.73 
 
 
764 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 
766 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 
735 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  29.73 
 
 
764 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
749 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.9 
 
 
861 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.9 
 
 
867 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.82 
 
 
862 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.29 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  24.4 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>